上海交通大学医学院新华医院心胸外科成立于1958年，至今已有50余年的历史，经过几代人的不懈努力，现已发展成为集医疗、教学、科研为一体的国内一流的心胸血管疾病诊治中心。2011年被评为国家临床重点专科。目前新华医院心胸外科能对所有的心胸血管外科疾病进行手术和介入等治疗，尤其在心脏瓣膜病、婴幼儿及复杂性先天性心脏病、冠心病、胸部大血管病、房颤、食管癌、肺癌手术及胸腔镜手术等外科治疗领域具有显著的特色和优势。学科人才云集，设备先进齐全，是国内唯一集成人和小儿于一体的最全面的心胸血管疾病外科诊疗中心， 学科水平处于国内领先地位。 科室设有病床82张、重症监护病床（ICU）23张，年手术量2000余例。
    科室现有教授、主任医师3名，副教授、副主任医师4名， 主治医师、住院医生15人， 中青年骨干均具有博士学位。 拥有中华医学会心胸血管外科分会委员1名，中国医师协会心血管外科分会委员1名，中国医师协会心血管外科分会瓣膜外科委员会副主任委员1名，中国医师协会心血管外科分会先心病、瓣膜病、冠心病、微创专业委员会委员5名，上海市心胸血管外科专业委员会委员1名。享受国务院特殊津贴专家1名。我科为上海交通大学医学院博士学位、硕士学位授予点。 已培养博士生12名、硕士生25名，在读博士研究生2人、硕士研究生6人。
    科研方面，心胸外科在冠心病的血管再生与外科手术，房颤外科及基础研究，瓣膜修复成形新技术，心脏移植免疫，肺癌和食管癌外科综合治疗等方面进行了长期、深入的基础研究和临床研究。已先后完成国家自然科学基金4项，市局级课题4项。目前在研课题有国家自然科学基金4项、上海市科委重点基础研究课题3项，其他市局级课题4项。
    心胸外科与美国Boston波士顿儿童医院、澳大利亚皇家Alfred王子医院心血管中心及Westmead儿童医院、美国马萨诸塞州立大学医学中心心脏外科、美国Colorado大学心血管医学中心等建立了友好协作关系， 长期互派学者交流学习。